尽管至今仍有人认为中国网民之多，各行业门户网站还有很好的发展前景，但客观上行业性门户网站大都已步入困境。曾经推广好一个行业门户网站就可以日进斗金的现象比比皆是，一个不到十人的小团队，一年数百万元广告费的收入，使得经营行业门户网站成为一个极佳的创富门路，无奈于这样的好光景将一去不返了。
行业门户网站之所以步入困境，无疑是行业门户网站越来越不受企业的欢迎，曾经传统媒体广告效应退化时，企业只要在门户网站投放广告了，无论招商加盟还是促销产品都能给企业带来不错的回报，但不到十年光景的行业门户网站，在媒体碎片化的全面到来之际，单纯的提供行业资讯和广告服务的行业门户网站，开始不再受更多的企业和消费者的关注，由此使行业门户网站的广告效果大打折扣，继而使企业在行业门户网站投放广告的信心受到动摇，也使得行业门户网站依赖企业广告生存成为困难。
互联网带来瞬息万变的种种社会现象，也包含了行业门户网站与时俱进的变化，一些行业门户网站开始转变广告服务商的单一职能，如家装行业出现土拨鼠、土巴兔、齐家网等新类型的行业门户类网站，这类网站虽然以广告经营为最直接目的，通过在搜索引擎投放广告赢得所处行业消费者的关注，且此类门户网站改变了传统门户网站的不亲民面貌，在网站显目位置的页面上设置让网友可以与广告主互动的栏目，如装修业主可以在门户网站里的《我要装修》之类的栏目留言和报名，门户网站既与消费者形成了互动，又通过这一互动措施收集客户信息，把这些有需求的装修客户信息分发给投放广告的装修公司和建材商，形成了广告费和客户信息互换的全新广告经营模式。
类似家装行业的新型门户网站，看起来是传统行业门户网站走出沼泽地的有效举措，而实际上却不然。这类网站通过向搜索引擎购买关键词，以竞价方式占据搜索引擎的排名。由于是关键词竞价来决定行业门户网站的排名先后，此类门户网站就得投入不菲的竞价费用来换取企业对网站流量的认可，因而才能赢得相应的广告客户。让这类门户网站感到要命的是，装修公司和建材公司虽然遍地开花，但这些传统行业的公司老板们几乎不熟悉互联网业务，因而能到门户网站去投放广告的企业就少得可怜。以福建福州市场为例，大小装修公司上千家，而能够在行业门户网站投放广告的装修公司不到20家，而且能够来投放广告的绝大多数又是规模及其小微的装修公司，也就是说来投放广告的都是没钱的主儿偏多！这就给家装行业门户网站迎头一击，网站排名要靠前才有客户来投放广告，而这个排名又得靠重金支撑着，能找来的广告主又是出不了高价钱的小微企业，残酷的现实使得家装行业门户网站步履维艰。据简单估算家装行业门户网站有数十个，但一些早期面世的也早已在吃尽苦头后退隐江湖，一些风投机构在门户网站烧钱落得血本无归而告退。
以家装行业门户网站为代表的行业门户网站，步入经营困境的还有一个让这些门户网站倍加绝望的发展趋势，那就是行业内的企业开始向莆系医疗行业学习，一些上规模有实力的家装企业不再把行业门户网站放在眼里，而是用重金砸向搜索引擎去推广企业自己的官网，使企业与行业门户网站形成竞争的对立面，如福州的有家装饰今年就计划投入百度竞价两百万元，这一区域性的投放金额完全超越行业门户网站在该区域的承受能力，这一现象的出现又很快引来上规模家装企业的效仿，可以肯定在不久的将来装修公司的网络推广就完全抄袭了医疗行业的做法。行业门户网站如果只服务一些小微企业，高竞价费用的投入和小微企业带来的低产出，就势必把行业门户网站逼向绝路。
当行业门户网站遭上规模企业冷落后，绝大多数行业门户网站迟早淡出江湖，各行各业的企业在失去门户网站的环境下该如何去推广自己的企业？对于各行业的上规模企业来说，这是造就寡头的绝好时机，没有了还有门户网站的市场将会更让资源向老大倾斜。而对于小微企业而言，独立生存空间越来越小，与其顽强地拼生存环境，还不如设法整合行业资源形成规模，或者投奔行业老大成为其旗下企业而形成合力，因为寡头时代被高度集中的不仅是广告资源，包括人力资源和物力资源都是小微企业所无力抗衡的。
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